近未来、世界の海は謎の侵略者「霧の艦隊」により制圧され、各大陸・島嶼は孤立した。人類社会vs「霧の艦隊」の構図の中で、霧の艦隊が美少女人格に顕現し交流して人間社会への理解を深め始める。、の艦隊を出奔した潜水艦イ401「イオナ」と海軍学校出の少年…